Calditrichaeota

Nowy typ bakterii Calditrichaeota jest zróżnicowany, rozpowszechniony i licznie występujący w osadach morskich i ma zdolność degradacji szkodliwych białek Ian PG Marshall i in. Environ Microbiol Rep . 2017 sie . Pokaż szczegóły

Pełne linki tekstowe Cytować

Abstrakcyjny Calditrichaeota to niedawno uznana gromada bakterii z trzema hodowanymi przedstawicielami, wyizolowanymi z kominów hydrotermalnych. Tutaj rozszerzamy filogenezę i ekologię tej nowej gromady o pochodzące z metagenomu i jednokomórkowe genomy sześciu niehodowanych bakterii, które wcześniej nie były uznawane za członków Calditrichaeota. Wykorzystując sekwencje genów 16S rRNA z tych genomów, zidentyfikowaliśmy następnie 322 sekwencje genów 16S rRNA z badań niezależnych od hodowli, które po raz pierwszy można sklasyfikować jako Calditrichaeota. Ten zestaw danych został wykorzystany do ponownej analizy zbioru zestawów danych amplikonu genu 16S rRNA z osadów morskich, pokazując, że Calditrichaeota są globalnie rozmieszczone na dnie morskim w dużej liczebności, stanowiąc do 6,7% całej społeczności bakterii. Ta szeroka dystrybucja i duża liczebność Calditrichaeota w zimnych osadach morskich nie została do tej pory rozpoznana. Wszystkie genomy Calditrichaeota wykazują oznaki metabolizmu chemoorganoheterotroficznego z możliwością degradacji białek detrytycznych poprzez zastosowanie peptydaz zewnątrzkomórkowych. Większość genomów zawiera geny kodujące białka, które nadają OTolerancja 2 , zgodna ze stosunkowo dużą liczebnością Calditrichaeota w powierzchniowej, bioturbowanej części dna morskiego i, wraz z genami kodującymi peptydazy zewnątrzkomórkowe, sugeruje ogólną niszę ekofizjologiczną tej nowo rozpoznanej gromady w osadach morskich.

Podobne artykuły Rozkład głębokości i montaż społeczności mikrobiologicznych redukujących siarczany w osadach morskich zatoki Aarhus. Jochum LM i in. Appl Environ Microbiol. 2017. PMID: 28939599 Bezpłatny artykuł PMC. Rzucanie światła na mechanizmy adaptacji i historię ewolucyjną powszechnej Sumerleoty. Fang Y i in. mBio. 2021. PMID: 33785617 Bezpłatny artykuł PMC. Różnorodność i metabolizm bakterii Woeseiales, globalnych członków zbiorowisk osadów morskich. Hoffmann K, i in. ISME J. 2020. PMID: 31988474 Bezpłatny artykuł PMC. Powszechne występowanie nowego podziału bakterii zidentyfikowanego przez sekwencje genów 16S rRNA pierwotnie znalezionych w głębokich osadach morskich. Webster G, et al. Appl Environ Microbiol. 2004. PMID: 15345467 Bezpłatny artykuł PMC. Nowa bioróżnorodność mikrobiologiczna w osadach morskich. Baker BJ i in. Ann Rev Mar Sci. 2021. PMID: 32746696 Recenzja. Zobacz wszystkie podobne artykuły Cytowany przez Porównawczy mikrobiom jelit u Trachypithecus leucocephalus i innych naczelnych w Guangxi w Chinach, na podstawie sekwencjonowania metagenomów. Que T i in. Mikrobiol zakaża przednią komórkę. 2022. PMID: 35601103 Bezpłatny artykuł PMC. Gigantyczne bakterie siarkowe (Beggiatoaceae) z osadów leżących pod systemem upwellingu Benguela są gospodarzem różnorodnych mikrobiomów. Flood BE, et al. PLoS Jeden. 2021. PMID: 34818329 Bezpłatny artykuł PMC. Geobiologia andyjskich ekosystemów mikrobiologicznych odkryta w Salar de Atacama w Chile. Vignale FA i in. Mikrobiol z przodu. 2021. PMID: 34777316 Bezpłatny artykuł PMC. Zmiany zróżnicowania i składu zbiorowiska bakterii ryzosferowych podczas naturalnych etapów odbudowy w kopalni antymonu. Duan R i in. PeerJ. 2021. PMID: 34721985 Bezpłatny artykuł PMC. Dysymilacyjna redukcja azotanów przez bakterię z kabla słodkowodnego. Marzocchi U, et al. ISME J. 2022. PMID: 34215856 Zobacz wszystkie artykuły „Cytowane przez” Rodzaje publikacji Wsparcie badawcze, rząd spoza USA Warunki MeSH Bakterie / klasyfikacja* Bakterie / genetyka Bakterie / izolacja i oczyszczanie* Bakterie / metabolizm Bioróżnorodność DNA, bakterie / genetyka Osad geologiczny / mikrobiologia* Metagenom Filogeneza Białka / metabolizm* RNA, rybosom, 16S / genetyka Woda morska / mikrobiologia Substancje DNA, bakterie Białka RNA, rybosom, 16S Powiązana informacja Montaż Genom MedGen Nukleotyd Nukleotyd Powiązany projekt Wsparcie dotacyjne 310039/ERC_/Europejska Rada ds. Badań Naukowych/Międzynarodowy LinkOut - więcej zasobów Źródła pełnego tekstu Wiley Inne źródła literatury cytować inteligentne cytaty Zasoby literatury NCBI

Siatka PKW Półka na książki Zastrzeżenie

ŚLEDŹ NCBI Połącz się z NLM

National Library of Medicine 8600 Rockville Pike Bethesda, MD 20894

Polityka internetowa FOIA HHS Ujawnianie luk w zabezpieczeniach

Pomoc Kariera w zakresie dostępności